Diseño de un modelo clasificatorio de predicción para la selección de moléculas con potencial actividad inhibitoria contra el Virus de la Inmunodeficiencia Humana tipo I (VIH-1)
Trabajo de grado - Pregrado
2024
El VIH-1 ha representado un desafío de salud pública desde su primera aparición en 1980.
Por esta razón, ha sido de vital importancia implementar diferentes metodologías que permitan el
desarrollo de fármacos eficaces para su control y posible eliminación. Los modelos predictivos
computacionales emergen como una alternativa prometedora para desarrollar nuevas
quimioterapias, como lo ejemplifica el Amprenavir (inhibidor de proteasa), cuyo desarrollo se
benefició de métodos computacionales.
Este estudio se enfoca en el desarrollo y evaluación de modelos predictivos para identificar
compuestos activos contra la proteasa del VIH-1, utilizando herramientas de bioinformática y
docking molecular. Se utilizó el software KNIME 5.2.5 para construir un modelo de predicción
robusto capaz de discriminar eficazmente entre compuestos activos e inactivos, con altos niveles
de exactitud, precisión y sensibilidad en la selección de candidatos prometedores.
Además, se llevó a cabo un análisis exhaustivo de docking molecular que identificó un
diterpeno clerodano y cuatro diterpenos cauranos con alta afinidad hacia el sitio activo de la
proteasa del VIH-1. Entre ellos, el compuesto 109 destacó significativamente por su energía de
unión más baja (-128,49 kJ/mol), indicando una interacción fuerte y estable. Los compuestos
restantes (234, 235, 231 y 230) también mostraron energías de unión favorables, sustentadas por
interacciones clave como enlaces de hidrógeno y fuerzas de Van der Waals.
El análisis detallado de las interacciones moleculares reveló que el compuesto 109 presentó
interacciones pi-sigma, pi-alquilo y alquilo que fortalecen la estabilidad del complejo ligando-
proteína. Asimismo, el ligando TL-3 mostró características únicas como interacciones pi-amida y
carga atractiva, contribuyendo a su mayor afinidad comparativa.
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En conclusión, estos hallazgos sugieren que los diterpenos clerodanos y los diterpenos
cauranos, especialmente el compuesto 109 derivado de Baccharis flabellata, representan
prometedores candidatos para el desarrollo de inhibidores de la proteasa del VIH-1, destacando su
potencial aplicación terapéutica en la lucha contra esta enfermedad viral.
- ASA. Tesis [5]
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